1633 yılında İstanbul – Kasımpaşa’da doğdu. Babası Mahmud Efendi’dir. İyi bir eğitim almıştır. Yüksek öğrenimini ünlü medreselerde tamamladıktan sonra müderrislik yapmıştır. Selanik şehri başta olmak üzere çok çeşitli yerlerde kadılık yapmıştır. Bu sıralarda “musiki” ile ilgilendiği için kendisine “eğlenceye düşkündür” denilmiş ve açığa alınmıştır. Bir süre geçimini hattatlığı sayesinde sağladıktan sonra affedilerek Bursa kadılığına yeniden tayin edilmiştir. Burada bilinmeyen bir sebeple oturmaya mecbur edilse de bir yıl sonra İstanbul’a dönmüştür. Abdülbaki Arif Efendi, 1713 yılında vefat etmiştir. Maalesef, neyzenin günümüze hiçbir eseri ulaşmamıştır.